Gamit

De acordo com a página do Gamit/Globk, “GAMIT, GLOBK, and TRACK form a comprehensive suite of programs for analyzing GPS measurements primarily to study crustal deformation.”.

Versões Disponíveis

• gamit/10.61

• gamit/10.70 (default)

Submissão de Jobs Seriais

Crie um arquivo chamado, por exemplo, submit_serial_jobs.sh.

#!/bin/bash
#SBATCH -t 7-00

export INPUT="run.sh 2018 sites.defaults"
export OUTPUT="*"

module load gamit/10.70
job-nanny ./run.sh

O script run.sh poderia ter o seguinte conteúdo:

#!/bin/bash

ln -s $GAMIT_PATH /home/your_username/gg

mkdir 2018
cd 2018/

mkdir tables
cp -r ../sites.defaults tables/.

sh_setup -yr 2018

## Set your e-mail properly
sed -i "s/set mailto = ''/set mailto = 'your_login@your_email.com.br'/" tables/process.defaults

cd tables/
sh_upd_stnfo -l sd
mv station.info.new station.info
cd ..

sh_gamit -expt eura -gnss G -s 2018 095 097 -pres ELEV -orbit igsf -copt x k p -dopts c ao              > sh_gamit_2018G.log
sh_gamit -expt eura -gnss R -s 2018 095 097 -jclock sp3 -pres ELEV -orbit codm -copt x k p -dopts c ao  > sh_gamit_2018R.log
sh_gamit -expt eura -gnss E -s 2018 095 097 -pres ELEV -orbit codm -copt x k p -dopts c ao              > sh_gamit_2018E.log
sh_gamit -expt eura -gnss C -s 2018 095 097 -pres ELEV -orbit codm -copt x k p -dopts c ao              > sh_gamit_2018C.log

sh_glred -cmd > sh_glred.log

sh_glred -s 2018 095 2018 097 -expt eura -gnss G R E C -opt R H G T                             > sh_glred_GREC.log
sh_glred -s 2018 095 2018 097 -expt eura -netext G R E C -ncomb 3 -globk_cmd_prefix COMB -opt G > sh_glred_comb.log

Para submeter o processo, basta usar o comando:

sbatch submit_serial_jobs.sh

Referências

Para informações adicionais sobre o software, consulte a documentação do Gamit/Globk.