Suporte #224
Atualização do Gromacs
| Status: | Resolvida | Start date: | 18 Nov 2010 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Priority: | Baixa | Due date: | |||
| Assignee: | Gabriel Winckler | % Done: | 90% | ||
| Category: | - | ||||
| Target version: | - |
Description
De asaraujo:
"Vi na documentação de vocês que a versão atual do Gromacs instalado no
grid é a 4.0.7. Existe a possibilidade ou previsão do upgrade desse
programa para a versão mais atual que é a 4.5.3?"
Ney: Podemos atualizar? (caso sim, transfira o bug para mim)
History
#1 Updated by Gabriel Winckler almost 16 years ago
- Status changed from Nova to Em andamento
- Assignee changed from Ney Lemke to Carlos Moreira
- Priority changed from Normal to Baixa
Em conversa com o Ney, ele concorda com a atualização do Gromacs, desde que seja em paralelo (mantendo a versão anterior).
Lembrara de compilar as 2 versões (precisão simples e dupla).
Cadu, estou te encaminhando o ticket. No ITS tem a instalação da versão anterior do Gromacs.
#2 Updated by Gabriel Winckler over 15 years ago
- Assignee changed from Carlos Moreira to Gabriel Winckler
- % Done changed from 0 to 90
Acabei de compilar a nova versão 4.5.4 e testar.
Também alterei o go para suportar o modo SMP.
Estou aguardando para tornar a versão padrão.
As instruções de compilação estão no applications.txt, mas reproduzo aqui:
export CC=icc export F77=ifort export MPICC=mpiicc ./configure --enable-threads --enable-float --without-x --prefix=/opt/GridUNESP/gromacs/gromacs-4.5.4 make -j6 make install ./configure --enable-threads --enable-float --without-x --prefix=/opt/GridUNESP/gromacs/gromacs-4.5.4 --enable-mpi --program-suffix=_mpi make -j6 mdrun make install-mdrun make distclean ./configure --enable-threads --enable-double --without-x --prefix=/opt/GridUNESP/gromacs/gromacs-4.5.4 make -j6 make install ./configure --enable-threads --enable-double --without-x --prefix=/opt/GridUNESP/gromacs/gromacs-4.5.4 --enable-mpi --program-suffix=_mpi_d make -j6 mdrun
#3 Updated by Gabriel Winckler over 15 years ago
- Status changed from Em andamento to Resolvida
Atualização liberada.