Problema #106
Instalação do Gromacs
| Status: | Resolvida | Start date: | 01 Mar 2010 | |
|---|---|---|---|---|
| Priority: | Normal | Due date: | 30 Apr 2010 | |
| Assignee: | Ney Lemke | % Done: | 0% | |
| Category: | - | Estimated time: | 20.00 hours | |
| Target version: | - |
Description
O Gromacs deve ser instalado e configurado.
History
#1 Updated by Ney Lemke over 16 years ago
A instalação do Gromacs seguiu basicamente os seguintes passos:
./configure --enable-threads --enable-float --with-fft=fftw2 --enable-mpi
make
make install
Além disso tivemos que instalar a biblioteca fftw2 nos nodos.
A instalação também implicou em uma reconfiguração da instalação do
Condor, pois a configuração não conseguia determinar os nodos
onde os processos mpi executavam.
Para facilitar a vida do usuário escrevemos uma página no Twiki:
https://www.ncc.unesp.br/twiki/bin/view/GuiaUsuario/GromacsSubmit
com detalhes sobre o processo de submissão.
Além disso escrevemos uma pequena digressão sobre a otimização de jobs condor mpi.
#2 Updated by Jadir da Silva over 16 years ago
- Project changed from NCC to Suporte (GridUNESP)
#3 Updated by Ney Lemke over 16 years ago
- Status changed from Nova to Resolvida