h1. Mugsy

h2. Envio local, exemplos de scripts

Informações sobre o uso direto do cluster local estão em [[SLURM|aqui]].

<pre>
#!/bin/bash
#SBATCH -t 5:00

module load mugsy
goo-job-nanny mugsy --directory . --prefix mugsy_serial mugsy_serial.fasta
</pre>

h2. Submissa Simplificada

{{include(SubmissaoSimplificadaCabecalho)}}

Exemplo:
<pre>
APP=mugsy
CASE=case
INPUT="genome1.fasta genome2.fasta genome3.fasta"
QUEUE=short
</pre>

Defaults do template:
* OUTPUT=$CASE.maf
* PROGRESS=$CASE.stderr

{{include(SubmissaoSimplificadaRodape)}}