ManyCore » History » Version 8

« Previous - Version 8/13 (diff) - Next » - Current version
Gabriel Winckler, 01 Jul 2013 17:07


ManyCore

Acessando o XeonPhi

A XeonPhi está instalada na máquina (phi01.ncc.unesp.br), para acessar você deve ter uma conta na base LDAP do NCC.

$ ssh phi01.ncc.unesp.br

Para garantir que um usuário/grupo utilize a XeonPhi por vez, nesta máquina encontra-se instalado o gerenciador de recursos, SLURM. Então toda vez que quiser utilizar o XeonPhi, você deve entrar na fila de espera para utilização. Utilize o comando abaixo para obter uma shell interativa:

$ srun --pty --gres=mic bash -i

Ao sair da shell automaticamente você liberará o recurso para outros utilizarem. Sua shell será finalizada após 1 hora, você pode alterar esse valor com o parametro walltime para o tempo máximo de utilização de 24 horas.

Para executar um script não interativo, e com tempo máximo de execução de 2 horas, execute:

$ srun --gres=mic -t 2:00:00 /home/user/script.sh

Para alocar 2 placas, use:

$ srun --gres=mic:2 /home/user/script.sh

Para ver a fila atual, execute:

$ squeue

Desta forma você estará na máquina que possui o XeonPhi instalado, para fazer ssh para a própria XeonPhi, execute:

$ ssh root@$(get_mics -1)

Compilação

No diretório /opt/ncc_demo/ existe o arquivo hello-openmp.c. Copie para o seu diretório.

Compilação OpenMP

# compilacao
icc -mmic -openmp hello-openmp.c -o hello-openmp

# copie o ambiente para o xeon phi
/opt/ncc-demo/copy-openmp-env.sh

Execução interativa

# aloque o recurso
srun --pty --gres=mic bash -i

# copie o seu executável
scp hello-openmp root@mic0:

# acesse o xeon phi
ssh root@$(get_mics -1)

# execute sua aplicação
./hello-openmp

# termine a sessão (2x)
exit
exit

Execução em fila

Alternativamente, para enviar o processo como job batch, prepare um arquivo (hello-openmp.sub):

#!/bin/bash
MIC=$(get_mics -1)
scp hello-openmp root@$MIC:
ssh root@$MIC /root/hello-openmp

e envie para a fila

chmod +x hello-openmp.sub
srun --gres=mic hello-openmp.sub

Also available in: PDF HTML TXT