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Current version
Gabriel Winckler, 01 Jul 2013 17:06
ManyCore¶
Acessando o XeonPhi¶
A XeonPhi está instalada na máquina (phi01.ncc.unesp.br), para acessar você deve ter uma conta na base LDAP do NCC.
$ ssh phi01.ncc.unesp.br
Para garantir que um usuário/grupo utilize a XeonPhi por vez, nesta máquina encontra-se instalado o gerenciador de recursos, SLURM. Então toda vez que quiser utilizar o XeonPhi, você deve entrar na fila de espera para utilização. Utilize o comando abaixo para obter uma shell interativa:
$ srun --pty --gres=mic bash -i
Ao sair da shell automaticamente você liberará o recurso para outros utilizarem. Sua shell será finalizada após 1 hora, você pode alterar esse valor com o parametro walltime para o tempo máximo de utilização de 24 horas.
Para executar um script não interativo, e com tempo máximo de execução de 2 horas, execute:
$ srun --gres=mic -t 2:00:00 /home/user/script.sh
Para alocar 2 placas, use:
$ srun --gres=mic:2 -t 2:00:00 /home/user/script.sh
Para ver a fila atual, execute:
$ squeue
Desta forma você estará na máquina que possui o XeonPhi instalado, para fazer ssh para a própria XeonPhi, execute:
$ ssh root@$(get_mics -1)
Compilação¶
No diretório /opt/ncc_demo/ existe o arquivo hello-openmp.c. Copie para o seu diretório.
Compilação OpenMP¶
# compilacao icc -mmic -openmp hello-openmp.c -o hello-openmp # copie o ambiente para o xeon phi /opt/ncc-demo/copy-openmp-env.sh
Execução interativa¶
# aloque o recurso srun --pty --gres=mic bash -i # copie o seu executável scp hello-openmp root@mic0: # acesse o xeon phi ssh root@$(get_mics -1) # execute sua aplicação ./hello-openmp # termine a sessão (2x) exit exit
Execução em fila¶
Alternativamente, para enviar o processo como job batch, prepare um arquivo (hello-openmp.sub):
#!/bin/bash MIC=$(get_mics -1) scp hello-openmp root@$MIC: ssh root@$MIC /root/hello-openmp
e envie para a fila
chmod +x hello-openmp.sub srun --gres=mic hello-openmp.sub