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Beraldo Leal, 28 Jun 2013 11:40


ManyCore

Acessando o XeonPhi

A XeonPhi está instalada na máquina (phi01.ncc.unesp.br), para acessar você deve ter uma conta na base LDAP do NCC.

$ ssh phi01.ncc.unesp.br

Para garantir que um usuário/grupo utilize a XeonPhi por vez, nesta máquina encontra-se instalado o gerenciador de recursos, Torque. Então toda vez que quiser utilizar o XeonPhi, você deve entrar na fila de espera para utilização. Utilize o comando abaixo para obter uma shell interativa:

$ qsub -I

Ao sair da shell automaticamente você liberará o recurso para outros utilizarem. Sua shell será finalizada após 1 hora, você pode alterar esse valor com o parametro walltime para o tempo máximo de utilização de 24 horas.

Para executar um script não interativo, e com tempo máximo de execução de 2 horas, execute:

$ qsub -l walltime=02:00:00 /home/user/script.sh

Para ver a fila atual, execute:

$ qstat

Desta forma você estará na máquina que possui o XeonPhi instalado, para fazer ssh para a própria XeonPhi, execute:

$ ssh root@mic0

Para maiores informações sobre submissões de jobs, utilizando o Torque, consulte o manual do torque.

Compilação

No diretório /opt/ncc_demo/ existe o arquivo hello-openmp.c. Copie para o seu diretório.

Compilação OpenMP

# compilacao
icc -mmic -openmp hello-openmp.c -o hello-openmp

# copie o ambiente para o xeon phi
/opt/ncc-demo/copy-openmp-env.sh

Execução interativa

# aloque o recurso
qsub -I

# copie o seu executável
scp hello-openmp root@mic0:

# acesse o xeon phi
ssh root@mic0

# execute sua aplicação
./hello-openmp

# termine a sessão (2x)
exit
exit

Execução em fila

Alternativamente, para enviar o processo como job batch, prepare um arquivo (hello-openmp.pbs):

#!/bin/bash
scp hello-openmp root@mic0:
ssh root@mic0 /root/hel

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