h1. LAMMPS

h2. Envio local, exemplos de scripts

Informações sobre o uso direto do cluster local estão em [[SLURM|aqui]].

h3. MPI

<pre>
#!/bin/bash
#SBATCH -t 5 -n 4 

module load lammps

goo-job-nanny srun -n 4 lmp -in in.reaxc.rdx -log lammps-mpi.log
</pre>


h2. Submissao Simplificada

{{include(SubmissaoSimplificadaCabecalho)}}


Exemplo:
<pre>
APP=lammps
CASE="lammps-parallel"
INPUT="in.reaxc.rdx data.rdx ffield.reax"
ARGS="-in in.reaxc.rdx -log ${CASE}.log"
OUTPUT="${CASE}.log"

HOSTS=4
QUEUE=short
</pre>

Defaults do template:
* ARGS=-in $INPUT
* PROGRESS=(stdout)

Parâmetros:
* CASE - Nome do caso. Define o nome de arquivos de entrada, log e saida. *Padrão:* (nome do arquivo de parâmetros, sem a extensão)
* HOSTS - Número de hosts (processos) para a execução. *Padrão:* 1 (modo serial)


{{include(SubmissaoSimplificadaRodape)}}