Artigos¶

(CLEANUP)

Publicações de pesquisadores e seus grupos que utilizaram recursos computacionais do GridUNESP

Modelagem e Simulação Computacional Aplicada ao Desenvolvimento de Novos Materiais¶

• L. G. M. de Macedo and A. R. de Souza, Fully Relativistic 4-Components DFT Investigation on Bonding and Dissociation Energy of !HgO, Journal of Computational and Theoretical Nanoscience, 8, 38-42 (2011).

• M. C. Gomes , D. M. G. Leite , J. R. Sambrano , J.H. D. da Silva and A. R. de Souza, Thermodynamic and electronic study of Ga1-xMnxN Films. A theoretical study. Surface Science, p. 1440 (2011).

• N. L. Marana , J. Sambrano and A. R. de Souza, Propriedades eletrônicas, estruturais e constantes elásticas do !ZnO. Química Nova (Impresso), 33, p. 810-815 ( 2010)

• M. C. Gomes-Maluf , J. H. Silva , S. R. Q. A. Zuliani , J. R. Sambrano and A. R. de Souza . Cálculos ab initio do semicondutor magnético diluído !GaMnN: elaboração do modelo da supercelula. In: 33 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2010, Águas de Lindóia/SP. Reunião Anual da SBQ, 2010.

• P. M. Silva , A. R. de Souza and J. R. Sambrano, Estudos de nós em proteinas com topologia 31. In: 33 RASBQ, 2010, Águas de Lindóia. 33 RASBQ, 2010.

• A. L. F. Canova and A. R. de Souza, Estudo do espaço ativo do elemento gálio. In: 33 RASBQ, 2010, Águas de Lindóia. 33 RASBQ, 2010.

• A. L. F. Canova , J. Sambrano and A. R. de Souza, MCHF methodology applied to material science. In: IX Encontro da SBPMat, 2010, Ouro Preto/MG. IX Encontro da SBPMat, 2010.

• A. R. de Souza and J. R. Sambrano , GridUNESP: The Emergence of a Virtual Organization. 11th International Conference on Advanced Materials , VIII Encontro SBPMat, (2009)

• A. R. de Souza et al., IX Brazilian MRS Meeting (SBPMat, 2010).

• N. H. Nicoleti, Modelagem Computacional de Óxidos da Família das Perovskitas. Tese de Doutoramento, Programa de Pós Graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais Advisor: J. R. Sambrano, Unesp, Bauru, (2011)

• F. J. Caires, L. S. Lima, C. T. Carvalho, A. B. Siqueira, Oswaldo Treu-Filho and M. Ionashiro,Thermal and spectroscopic data to investigate the oxamic acid, sodium oxamate and its compounds with some bivalent transition metal ions

• D. A. Galico, B. B. Holanda, G. L. Perpetuo, E. Schnitzler, O. Treu-Filho, G. Bannach, Thermal and spectroscopic studies on solid Ketoprofen of lighter trivalent lanthanides

Simulações Numéricas em Cromodinâmica Quântica¶

• R. R. Leme, Dissertacao de Mestrado: Teoria quântica do campo escalar real com autoacoplamento quártico – simulações de Monte Carlo na rede com um algoritmo worm

• R. R. Leme, Poster apreentado no Encontro de Fisica 2011 , Foz do Iguacu, 5 a 10 de junho de 2011 "Simulation of the lattice phi**4 quantum-field theory with the worm algorithm"

• R. R. Leme, Teoria quântica do campo escalar real com autoacoplamento quártico – simulações de Monte Carlo na rede com um algoritmo worm , UNESP - Universidade Estadual Paulista.

• F. Attanasio, Optimized strong coupling expansion - phi**4 theory. Dissertacao de mestrado (em andamento)

Biofísica Computacional¶

• P. R. Costa, M. L. Acencio and N. Lemke, A machine learning approach for genome-wide prediction of morbid and druggable human genes based on systems-level data. BMC Genomics, 11, p. S9, (2010)

• M. L. Acencio and N. Lemke, Construction and analysis of an integrated network of human genes involved in G1/S cell cycle transition regulation by anchorage to extracellular matrix. In: XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011. Livro de Resumos do XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011.

• M. L. Acencio, Construção e análise da rede integrada de interações entre genes humanos envolvida com a regulação da transição G1/S do ciclo celular pela adesão à matriz extracelular. PhD Thesis. UNESP - Univ Estadual Paulista.

• F. F. Matioli et al, Molecular dynamics simulations of docking complexes between a P-I metaloprotease from Bothrops neuwiedi venom and the inhibitor ester triacontil p-coumarate using a computational grid infrastructure. In: XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011. Livro de Resumos do XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011.

• Marcio L Acencio and Ney Lemke;Towards the prediction of essential genes by integration of network toTowards the prediction of essential genes by integration of network topology, cellular localization and biological process information

• Lemke, N. and Campbell, Ian A., Stretched-exponential behavior and random walks on diluted hypercubic lattices

Caos, aceleração de Fermi e Transições de fase em sistemas dinâmicos*¶

• E. D. Leonel,Diego F M Oliveira Parameter-space for a dissipative Fermi-Ulam model. Physical Review E.

• Edson D. Leonel, Diogo R. da Costa, Carl P. Dettmann, Scaling invariance for the escape of particles from a periodically corrugated waveguide

• D. F. T. de Sousa , R. N. C. Filho and E. D. Leonel, A dissipative Fermi Ulam model with two nonlinearities: boundary crisis and the parameter-space. Journal of Physics A.

• Diego F.M. Oliveira, Marko Robnik, Edson D. Leonel, Statistical properties of a dissipative kicked system: Critical exponents and scaling invariance

• Diego F. M. Oliveira, Marko Robnik, and Edson D. Leonel, Shrimp-shape domains in a dissipative kicked rotator

Estrutura eletrônica de materiais¶

Iniciação científica:

• R. M. Ferreira (Fapesp), projeto Complexos supramoleculares de precursores de materiais óxidos avançados.

• L. C. D. Aguiar (PIC-DF), projeto Estrutura eletrônica de materiais: nanopartículas de nitreto de gálio dopadas com manganês.

Estudo dos processos de fotodissociação e reatividade do polímero orgânico conjugado meh-ppv em solução sob radiação ionizante*¶

• A. Batagin-Neto, E. Bronze-Uhle, D. Fernandes, I. Fratoddi, I. Venditti, F. Decker, E. Bodo, M. V. Russo and C. Graeff, Optical Behavior of Conjugated Pt-Containing Polymetallaynes Exposed to Gamma-Ray Radiation Doses . The Journal of Physical Chemistry. Manuscript ID: jp-2011-00831z.R1

• E. S. Bronze-Uhle, A. Batagin-Neto, F. C. Lavarda, and C. F. O. Graeff, Ionizing radiation induced degradation of poly (2-methoxy-5-(2’-ethyl-hexyloxy) -1,4-phenylene vinylene) in solution

Métodos Analíticos e Numéricos em Mecânica Computacional¶

• D. Kinoshita and J.L. Gasche, Influence of the evaporator position in static domestic refrigerators, International Congress of Refrigeration, Praga, 21 a 28/08/2011.

• F. Barbi, J.L. Gasche and T. Andreotti, Numerical Simulation of the Flow Thorugh a Compressor Valve Model Using Immersed Boundary Method and Adaptative Mesh Refinement , COBEM 2011.

• Franco Barbi, Iara de Souza Barbosa, José Luiz Gasche and Sergio Said Mansur, Simulação numérica do escoamento oscilatório em um difusor radial com alimentação axial, Anais da EPTT 2010, VII Escola de Primavera de Transição e Turbulência , 27 de setembro a 01 de outubro de 2010, Ilha Solteira – SP, Brasil

• D. Kinoshita, Simulação Numérica da Convecção Natural no Interior de um Refrigerador Doméstico , Dissertação de mestrado, abril 2011.

• T. Andreotti, Interação Fluido-estrutura no Escoamento em Válvulas de Compressores. Dissertação de mestrado (em andamento)

• F. Barbi, Simulação Numérica do Escoamento e Válvulas de Compressores Usando o Método da Fronteira Imersa. Dissertação de mestrado (em andamento)

Núcleo de Computação Científica¶

• R. L. Iope, Estratégias de controle dinâmico de caminhos ópticos em redes fotônicas WDM utilizando inteligência de enxame. PhD Thesis. USP - Escola Politécnica - Departamento de Engenharia de Computação e Sistemas Digitais (2011)

• R. L. Iope, in Proceedings of the Second EELA-2 Conference, eds. R. Mayo et al (CIEMAT 2009), p. 257.

• R. L. Iope, N. Lemke, G. A. von Winckler, GridUNESP: a multi-campus Grid infrastructure for scientific computing, in Proceedings of the 3rd Latin American Conference on High Performance Computing (CLCAR 2010), 25-28 August 2010, Gramado, pp. 76-84.

A definir¶

• Lidiane G. Felippea, João M. Batista Jr.a, Debora C. Baldoquib, Isabele R. Nascimentoa, Massuo J. Katoc, Vanderlan S. Bolzania, Maysa Furlana, Structure and absolute configuration of a secolignan from Peperomia blanda

• F. A. Garcia, P. A. Venegas, P. G. Pagliuso, C. Rettori, Z. Fisk, P. Schlottmann, and S. B. Oseroff, Thermally activated exchange narrowing of the Gd3+ ESR fine structure in a single crystal of Ce1-xGdxFe4P12 (x≈0.001) skutterudite

• R. P. Simões, P. A. Venegas and D. F. Mello, Role of Interstitial Pinning in the Dynamical Phases of Vortices in Superconducting Films