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Version 3 (Allan Szu, 04 Apr 2012 10:45) → Version 4/39 (Allan Szu, 04 Apr 2012 10:48)
h1. Artigos
(CLEANUP)
Publicações de pesquisadores e seus grupos que utilizaram recursos computacionais do GridUNESP
h2. Modelagem e Simulação Computacional Aplicada ao Desenvolvimento de Novos Materiais
** L. G. M. de Macedo and A. R. de Souza, _Fully Relativistic 4-Components DFT Investigation on Bonding and Dissociation Energy of !HgO_, Journal of Computational and Theoretical Nanoscience, *8*, 38-42 (2011).
** M. C. Gomes , D. M. G. Leite , J. R. Sambrano , J.H. D. da Silva and A. R. de Souza, _Thermodynamic and electronic study of Ga1-xMnxN Films. A theoretical study_. Surface Science, p. 1440 (2011).
** N. L. Marana , J. Sambrano and A. R. de Souza, _Propriedades eletrônicas, estruturais e constantes elásticas do !ZnO_. Química Nova (Impresso), *33*, p. 810-815 ( 2010)
** M. C. Gomes-Maluf , J. H. Silva , S. R. Q. A. Zuliani , J. R. Sambrano and A. R. de Souza . _Cálculos ab initio do semicondutor magnético diluído !GaMnN: elaboração do modelo da supercelula_. In: 33 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2010, Águas de Lindóia/SP. Reunião Anual da SBQ, 2010.
** P. M. Silva , A. R. de Souza and J. R. Sambrano, _Estudos de nós em proteinas com topologia 31_. In: 33 RASBQ, 2010, Águas de Lindóia. 33 RASBQ, 2010.
** A. L. F. Canova and A. R. de Souza, _Estudo do espaço ativo do elemento gálio_. In: 33 RASBQ, 2010, Águas de Lindóia. 33 RASBQ, 2010.
** A. L. F. Canova , J. Sambrano and A. R. de Souza, _MCHF methodology applied to material science_. In: IX Encontro da SBPMat, 2010, Ouro Preto/MG. IX Encontro da SBPMat, 2010.
** A. R. de Souza and J. R. Sambrano , _GridUNESP: The Emergence of a Virtual Organization. 11th International Conference on Advanced Materials_ , VIII Encontro SBPMat, (2009)
** N. H. Nicoleti, _Modelagem Computacional de Óxidos da Família das Perovskitas_. Tese de Doutoramento, Programa de Pós Graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais Advisor: J. R. Sambrano, Unesp, Bauru, (2011)
h2. Simulações Numéricas em Cromodinâmica Quântica
** R. R. Leme, Dissertacao de Mestrado: _Teoria quântica do campo escalar real com autoacoplamento quártico – simulações de Monte Carlo na rede com um algoritmo worm_
** R. R. Leme, _Poster apreentado no Encontro de Fisica 2011_ , Foz do Iguacu, 5 a 10 de junho de 2011 "Simulation of the lattice phi**4 quantum-field theory with the worm algorithm"
** R. R. Leme, _Teoria quântica do campo escalar real com autoacoplamento quártico – simulações de Monte Carlo na rede com um algoritmo worm_ , UNESP - Universidade Estadual Paulista.
** F. Attanasio, _Optimized strong coupling expansion - phi**4 theory_. Dissertacao de mestrado (em andamento)
h2. Biofísica Computacional
** P. R. Costa, M. L. Acencio and N. Lemke, _A machine learning approach for genome-wide prediction of morbid and druggable human genes based on systems-level data_. BMC Genomics, *11*, p. S9, (2010)
** M. L. Acencio and N. Lemke, _Construction and analysis of an integrated network of human genes involved in G1/S cell cycle transition regulation by anchorage to extracellular matrix_. In: XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011. Livro de Resumos do XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011.
** M. L. Acencio, _Construção e análise da rede integrada de interações entre genes humanos envolvida com a regulação da transição G1/S do ciclo celular pela adesão à matriz extracelular_. PhD Thesis. UNESP - Univ Estadual Paulista.
** F. F. Matioli et al, _Molecular dynamics simulations of docking complexes between a P-I metaloprotease from Bothrops neuwiedi venom and the inhibitor ester triacontil p-coumarate using a computational grid infrastructure_. In: XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011. Livro de Resumos do XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011.
** Marcio L Acencio and Ney Lemke;Towards the prediction of essential genes by integration of network toTowards the prediction of essential genes by integration of network topology, cellular localization and biological process information
h2. Caos, aceleração de Fermi e Transições de fase em sistemas dinâmicos*
** E. D. Leonel, _Parameter-space for a dissipative Fermi-Ulam model_. Physical Review E.
** D. F. T. de Sousa , R. N. C. Filho and E. D. Leonel, _A dissipative Fermi Ulam model with two nonlinearities: boundary crisis and the parameter-space_. Journal of Physics A.
h2. Estrutura eletrônica de materiais
Iniciação científica:
** R. M. Ferreira (Fapesp), projeto _Complexos supramoleculares de precursores de materiais óxidos avançados_.
** L. C. D. Aguiar (PIC-DF), projeto _Estrutura eletrônica de materiais: nanopartículas de nitreto de gálio dopadas com manganês_.
h2. Estudo dos processos de fotodissociação e reatividade do polímero orgânico conjugado meh-ppv em solução sob radiação ionizante*
** A. Batagin-Neto, E. Bronze-Uhle, D. Fernandes, I. Fratoddi, I. Venditti, F. Decker, E. Bodo, M. V. Russo and C. Graeff, _Optical Behavior of Conjugated Pt-Containing Polymetallaynes Exposed to Gamma-Ray Radiation Doses_ . The Journal of Physical Chemistry. Manuscript ID: jp-2011-00831z.R1
h2. Métodos Analíticos e Numéricos em Mecânica Computacional
** D. Kinoshita and J.L. Gasche, _Influence of the evaporator position in static domestic refrigerators_, International Congress of Refrigeration, Praga, 21 a 28/08/2011.
** F. Barbi, J.L. Gasche and T. Andreotti, _Numerical Simulation of the Flow Thorugh a Compressor Valve Model Using Immersed Boundary Method and Adaptative Mesh Refinement_ , COBEM 2011.
** Franco Barbi, Iara de Souza Barbosa, José Luiz Gasche and Sergio Said Mansur, _Simulação numérica do escoamento oscilatório em um difusor radial com alimentação axial_, Anais da EPTT 2010, VII Escola de Primavera de Transição e Turbulência , 27 de setembro a 01 de outubro de 2010, Ilha Solteira – SP, Brasil
** D. Kinoshita, _Simulação Numérica da Convecção Natural no Interior de um Refrigerador Doméstico_ , Dissertação de mestrado, abril 2011.
** T. Andreotti, _Interação Fluido-estrutura no Escoamento em Válvulas de Compressores_. Dissertação de mestrado (em andamento)
** F. Barbi, _Simulação Numérica do Escoamento e Válvulas de Compressores Usando o Método da Fronteira Imersa_. Dissertação de mestrado (em andamento)
h2. Núcleo de Computação Científica
** R. L. Iope, _Estratégias de controle dinâmico de caminhos ópticos em redes fotônicas WDM utilizando inteligência de enxame_. PhD Thesis. USP - Escola Politécnica - Departamento de Engenharia de Computação e Sistemas Digitais (2011)
** R. L. Iope, in Proceedings of the Second EELA-2 Conference, eds. R. Mayo et al (CIEMAT 2009), p. 257.
** R. L. Iope, N. Lemke, G. A. von Winckler, GridUNESP: a multi-campus Grid infrastructure for scientific computing, in Proceedings of the 3rd Latin American Conference on High Performance Computing (CLCAR 2010), 25-28 August 2010, Gramado, pp. 76-84.
(CLEANUP)
Publicações de pesquisadores e seus grupos que utilizaram recursos computacionais do GridUNESP
h2. Modelagem e Simulação Computacional Aplicada ao Desenvolvimento de Novos Materiais
** L. G. M. de Macedo and A. R. de Souza, _Fully Relativistic 4-Components DFT Investigation on Bonding and Dissociation Energy of !HgO_, Journal of Computational and Theoretical Nanoscience, *8*, 38-42 (2011).
** M. C. Gomes , D. M. G. Leite , J. R. Sambrano , J.H. D. da Silva and A. R. de Souza, _Thermodynamic and electronic study of Ga1-xMnxN Films. A theoretical study_. Surface Science, p. 1440 (2011).
** N. L. Marana , J. Sambrano and A. R. de Souza, _Propriedades eletrônicas, estruturais e constantes elásticas do !ZnO_. Química Nova (Impresso), *33*, p. 810-815 ( 2010)
** M. C. Gomes-Maluf , J. H. Silva , S. R. Q. A. Zuliani , J. R. Sambrano and A. R. de Souza . _Cálculos ab initio do semicondutor magnético diluído !GaMnN: elaboração do modelo da supercelula_. In: 33 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2010, Águas de Lindóia/SP. Reunião Anual da SBQ, 2010.
** P. M. Silva , A. R. de Souza and J. R. Sambrano, _Estudos de nós em proteinas com topologia 31_. In: 33 RASBQ, 2010, Águas de Lindóia. 33 RASBQ, 2010.
** A. L. F. Canova and A. R. de Souza, _Estudo do espaço ativo do elemento gálio_. In: 33 RASBQ, 2010, Águas de Lindóia. 33 RASBQ, 2010.
** A. L. F. Canova , J. Sambrano and A. R. de Souza, _MCHF methodology applied to material science_. In: IX Encontro da SBPMat, 2010, Ouro Preto/MG. IX Encontro da SBPMat, 2010.
** A. R. de Souza and J. R. Sambrano , _GridUNESP: The Emergence of a Virtual Organization. 11th International Conference on Advanced Materials_ , VIII Encontro SBPMat, (2009)
** N. H. Nicoleti, _Modelagem Computacional de Óxidos da Família das Perovskitas_. Tese de Doutoramento, Programa de Pós Graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais Advisor: J. R. Sambrano, Unesp, Bauru, (2011)
h2. Simulações Numéricas em Cromodinâmica Quântica
** R. R. Leme, Dissertacao de Mestrado: _Teoria quântica do campo escalar real com autoacoplamento quártico – simulações de Monte Carlo na rede com um algoritmo worm_
** R. R. Leme, _Poster apreentado no Encontro de Fisica 2011_ , Foz do Iguacu, 5 a 10 de junho de 2011 "Simulation of the lattice phi**4 quantum-field theory with the worm algorithm"
** R. R. Leme, _Teoria quântica do campo escalar real com autoacoplamento quártico – simulações de Monte Carlo na rede com um algoritmo worm_ , UNESP - Universidade Estadual Paulista.
** F. Attanasio, _Optimized strong coupling expansion - phi**4 theory_. Dissertacao de mestrado (em andamento)
h2. Biofísica Computacional
** P. R. Costa, M. L. Acencio and N. Lemke, _A machine learning approach for genome-wide prediction of morbid and druggable human genes based on systems-level data_. BMC Genomics, *11*, p. S9, (2010)
** M. L. Acencio and N. Lemke, _Construction and analysis of an integrated network of human genes involved in G1/S cell cycle transition regulation by anchorage to extracellular matrix_. In: XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011. Livro de Resumos do XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011.
** M. L. Acencio, _Construção e análise da rede integrada de interações entre genes humanos envolvida com a regulação da transição G1/S do ciclo celular pela adesão à matriz extracelular_. PhD Thesis. UNESP - Univ Estadual Paulista.
** F. F. Matioli et al, _Molecular dynamics simulations of docking complexes between a P-I metaloprotease from Bothrops neuwiedi venom and the inhibitor ester triacontil p-coumarate using a computational grid infrastructure_. In: XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011. Livro de Resumos do XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2011.
** Marcio L Acencio and Ney Lemke;Towards the prediction of essential genes by integration of network toTowards the prediction of essential genes by integration of network topology, cellular localization and biological process information
h2. Caos, aceleração de Fermi e Transições de fase em sistemas dinâmicos*
** E. D. Leonel, _Parameter-space for a dissipative Fermi-Ulam model_. Physical Review E.
** D. F. T. de Sousa , R. N. C. Filho and E. D. Leonel, _A dissipative Fermi Ulam model with two nonlinearities: boundary crisis and the parameter-space_. Journal of Physics A.
h2. Estrutura eletrônica de materiais
Iniciação científica:
** R. M. Ferreira (Fapesp), projeto _Complexos supramoleculares de precursores de materiais óxidos avançados_.
** L. C. D. Aguiar (PIC-DF), projeto _Estrutura eletrônica de materiais: nanopartículas de nitreto de gálio dopadas com manganês_.
h2. Estudo dos processos de fotodissociação e reatividade do polímero orgânico conjugado meh-ppv em solução sob radiação ionizante*
** A. Batagin-Neto, E. Bronze-Uhle, D. Fernandes, I. Fratoddi, I. Venditti, F. Decker, E. Bodo, M. V. Russo and C. Graeff, _Optical Behavior of Conjugated Pt-Containing Polymetallaynes Exposed to Gamma-Ray Radiation Doses_ . The Journal of Physical Chemistry. Manuscript ID: jp-2011-00831z.R1
h2. Métodos Analíticos e Numéricos em Mecânica Computacional
** D. Kinoshita and J.L. Gasche, _Influence of the evaporator position in static domestic refrigerators_, International Congress of Refrigeration, Praga, 21 a 28/08/2011.
** F. Barbi, J.L. Gasche and T. Andreotti, _Numerical Simulation of the Flow Thorugh a Compressor Valve Model Using Immersed Boundary Method and Adaptative Mesh Refinement_ , COBEM 2011.
** Franco Barbi, Iara de Souza Barbosa, José Luiz Gasche and Sergio Said Mansur, _Simulação numérica do escoamento oscilatório em um difusor radial com alimentação axial_, Anais da EPTT 2010, VII Escola de Primavera de Transição e Turbulência , 27 de setembro a 01 de outubro de 2010, Ilha Solteira – SP, Brasil
** D. Kinoshita, _Simulação Numérica da Convecção Natural no Interior de um Refrigerador Doméstico_ , Dissertação de mestrado, abril 2011.
** T. Andreotti, _Interação Fluido-estrutura no Escoamento em Válvulas de Compressores_. Dissertação de mestrado (em andamento)
** F. Barbi, _Simulação Numérica do Escoamento e Válvulas de Compressores Usando o Método da Fronteira Imersa_. Dissertação de mestrado (em andamento)
h2. Núcleo de Computação Científica
** R. L. Iope, _Estratégias de controle dinâmico de caminhos ópticos em redes fotônicas WDM utilizando inteligência de enxame_. PhD Thesis. USP - Escola Politécnica - Departamento de Engenharia de Computação e Sistemas Digitais (2011)
** R. L. Iope, in Proceedings of the Second EELA-2 Conference, eds. R. Mayo et al (CIEMAT 2009), p. 257.
** R. L. Iope, N. Lemke, G. A. von Winckler, GridUNESP: a multi-campus Grid infrastructure for scientific computing, in Proceedings of the 3rd Latin American Conference on High Performance Computing (CLCAR 2010), 25-28 August 2010, Gramado, pp. 76-84.