.. Exabayes:

ExaBayes
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De acordo com a `página do ExaBayes <https://sco.h-its.org/exelixis/web/software/exabayes/>`_,
"*ExaBayes is a software package for Bayesian tree inference. It is particularly
suitable for large-scale analyses on computer clusters*".


Versões Disponíveis
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* exabayes/1.5


Submissão de Jobs em Paralelo
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Crie um arquivo chamado, por exemplo, *submit_paral_jobs.sh*.

.. code-block:: bash

   #!/bin/bash
   #SBATCH -t 20-00 -n 60

   export INPUT="aln.phy config.nex"
   export OUTPUT="*"

   module load exabayes
   job-nanny mpirun -np 60 exabayes -f aln.phy -m PROT -c config.nex -n 321 -s 123 -M 3 -S

Para submeter o processo, basta usar o comando:

.. code-block:: bash

   sbatch submit_paral_jobs.sh


Submissão de Jobs Seriais
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Crie um arquivo chamado, por exemplo, *submit_serial_jobs.sh*.

.. code-block:: bash

   #!/bin/bash
   #SBATCH -t 20-00

   export INPUT="aln.phy config.nex"
   export OUTPUT="*"

   module load exabayes
   job-nanny yggdrasil -f aln.phy -m PROT -c config.nex -n 100 -s 123 -M 3 -S


Para submeter o processo, basta usar o comando:

.. code-block:: bash

   sbatch submit_serial_jobs.sh


Referências
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Para informações adicionais sobre o software, consulte a
`documentação do ExaBayes <https://sco.h-its.org/exelixis/web/software/exabayes/manual/index.html>`_.